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El día 21 de febrero de 2006 el SAG decidió prohibir en forma absoluta la internación al territorio nacional de aves vivas que no tengan como destino la industria avícola de carne o de postura, para resguardar el ingreso de la influenza aviar, ante su rápida expansión en Europa y Asia. Esta medida se suma a las acciones actualmente vigentes, tales como la vigilancia sanitaria internacional, un mayor control fronterizo y un programa de vigilancia epidemiológica, y fue adoptada considerando que la información científica indica que muchas especies de aves son susceptibles de infectarse, ser portadoras y diseminar el virus de la influenza aviar. Entre ellas se incluyen algunas que se usan como mascotas.
En todo caso, en el marco del Sistema de Vigilancia Activa implementado por el SAG se han analizado más de 100.000 muestras serológicas tomadas de aves en zonas claves del país, todas las cuales han dado resultados negativos.
Las autoridades de la Unión Europea también han tomado una serie de medidas para evitar la propagación de esta enfermedad. Entre ellas destaca una mayor vigilancia a los viajeros procedentes de terceros países.
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Los brotes de influenza aviar provocados por el virus H5N1 registrados en Asia y Europa y que han causado la muerte de millones de aves y de 60 personas que han estado en contacto con ellas, han generado preocupación mundial debido a la posibilidad cierta, según los expertos, de que, por una parte, se expanda al resto del mundo provocando graves daños a la industria avícola mundial y, por otra, se produzca una mutación del virus y éste sea capaz de transmitirse entre los seres humanos, lo que generaría una pandemia de graves consecuencias. Ante este posible escenario, el Gobierno ha elaborado un plan de acción que permitirá reducir el impacto del virus en el país.
Una parte importante de este plan está bajo la responsabilidad del SAG, organismo del MINAGRI que cuenta con un completo Sistema de Control, que implica altas exigencias sanitarias a las importaciones de productos avícolas, un rígido control fronterizo para evitar el ingreso de productos avícolas contaminados, la prevención de enfermedades exóticas transmitidas por aves silvestres y una vigilancia activa y permanente sobre las empresas productoras de aves y sobre aves caseras.
Este Sistema ya ha sido utilizado exitosamente con anterioridad, específicamente en el año 2002, cuando se detectó un foco de gripe aviar que fue rápidamente controlado y erradicado por el SAG. Desde entonces este Sistema ha estado funcionando permanentemente, sin detectarse la presencia del virus hasta ahora.