El comercio silvoagropecuario de Chile con Japón se compone casi en su totalidad de exportaciones chilenas al país asiático. Éste es actualmente el cuarto mayor mercado para los envíos chilenos del sector, los cuales alcanzaron en 2012 un monto de USD 1.050,3 millones, que equivale al 12,5% de las exportaciones totales de Chile a Japón. Luego de la contracción registrada en 2009, los envíos agropecuarios y forestales a Japón han retomado su crecimiento, con tasas de 14,9% en 2010, 30,9% en 2011, y un crecimiento más leve de 1,5% en 2012.
El Acuerdo de Asociación Económica Estratégica vigente desde 2007 ha contribuido a sostener este impulso, a pesar de que el alcance de la desgravación obtenida para los productos chilenos fue parcial, por la alta sensibilidad de muchos productos agrícolas en Japón. Lo anterior ha sido sorteado, en parte, a través de la negociación de condiciones de acceso mediante contingentes arancelarios (cuotas) para algunos productos agrícolas y pecuarios chilenos. Además, existen instancias vigentes para continuar las negociaciones sobre el tratamiento a otros productos que no fueron liberados arancelariamente al inicio del Acuerdo.
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